どんな願いも叶えると約束された全能の聖杯は、以前に三度の血なまぐさい戦争を引き起こし、それぞれが勝者を授けるほど容赦なく戦い続けた。しかし、裕福なエインツベルン一族は第四聖杯戦争が異なると信じており、現在彼らは聖杯の容器を所有している。この一つだけで、嫌われる「マグスキラー」絵美夜桜司はエインツベルンに雇われ、唯一の娘イリスヴィールとの結婚を契約として締結する。桜司は無慈悲な生存競争の中心に立ち、六人の対戦相手と対峙し、各々が古代のフェイミリアを操り、独自の野望に駆られている。彼自身のフェイミリア・サーベルとともに、悪名高い傭兵はすぐに最も凶暴な敵である聖職者コトミネ・キレイと対峙する。彼は自身の内なる虚無から救済を求めつつ、桜司を追い続けている。戦闘は歴史と神話の各時代から召喚師を集め、英雄たちを呼び寄せて聖杯の力を争わせる。彼らの動機は復讐から野望まで多岐にわたり、同盟は脆弱で裏切りは避けられない。原作は浦上玄のライトノベルに基づき、ファイト/ゼロは第四聖杯戦争――フェイト/stay nightの十年前を描く。生存が保証されない致命的な対決を観察せよ。