絶望的に、エドワード・エルリックはアルフォンスを救うために自らの肉体と精神を捧げ、今やドイツ・ミュンヘンの中心に投げ込まれた。彼は第一次世界大戦終結後の経済混乱の中、全く異質な領域に適応しようと闘う。家へ帰ることも、錬金術の力を使って脱出することもできず、エドワードは自らが放棄した多くの仲間に似た協力者とともに、刑務所からの別ルート脱出を模索し続ける。ドイツ人の不安が高まる中、隣国も名誉を失ったこの国の混乱を感じ取る。 同時に、アルフォンスはエドワードの消失行為を追究し続け、錬金術の科学を研究してやっと兄と再会できることを願っている。
