Отчаянно Эдвард Элрик отдал свою плоть и дух, чтобы спасти Альфонса, и теперь оказывается в центре Мюнхена, Германия. Он борется за адаптацию к совершенно чужому ему миру в разгар экономических потрясений, которые последовали после окончания Первой мировой войны. Оказавшись изолированным и не в состоянии вернуться домой, используя свои алхимические способности, Эдвард продолжает исследовать альтернативные пути побега из тюрьмы вместе с соратниками, напоминающими многих тех, кого он оставил позади. По мере того как в Германии разгорается недовольство, соседние страны также ощущают волнения от позорной нации.
В то же время Альфонс продолжает исследовать исчезновение Эдварда, изучая науку алхимии в надежде наконец объединиться со старшим братом.