フユキ市で行われる第五の聖杯戦争は臨界点に達し、隠された敵がついに姿を現すことで参加者全員を危険にさらしています。エミヤ・シロウ、トオサカ・リン、そしてイリャスヴィル・フォン・アインズバーンが街を荒らし続ける闇の真の腐敗性を知ったとき、彼らは危機の深刻さを痛感します。愛する者たちを守るため、三人はほぼ無敵に近い敵と対峙しなければならず、かつては味方だったりさらに親しい存在であった敵も含まれます。この激動の戦争のクライマックスが展開する中、シロウの信念は痛ましい試練に直面します。究極的に救えるか、破滅したように見える世界を本当に救うことができるのか?