江戸川コナン、探偵団、および阿笠弘志教授は、西田町ツインタワーを見学することに決めました。そこで彼らは毛利蘭、彼女の親友鈴木園子、そして蘭のお父さんである有名な小五郎に出会います。三人はタワーの盛大な開業式に参加し、コナンと仲間たちはその階をプライベートで散策します。しかし、式の準備が最終段階に入った直前、不意の展開が起こります―三件の残忍な殺人事件が発生し、謎のポルシェ356Aと関連しているようです。その直後、コナンと探偵たちがさらに調査を進めると、緊急事態の中でタワーが爆発します。炎が速やかに広がり、命の危険が迫る中、警察は急ぎで全員を避難させようとします。エレベーター――唯一の脱出ルートが機能しなくなると、コナンと仲間たちは内部に取り残されます。救助隊が到着するまで、彼らは建物内のすべての人を守ろうと必死に動きますが、犯人を捕まえるための時間は逆行しています。
