悪名高い泥棒怪盗キッドからの手紙を受け取った後、人気女優マキジュリは私立探偵の毛利小五郎に、信仰・運命・希望を体現するとされる「星のサファイア」―いわゆる「運命の宝石」―を守る手助けを求めた。小五郎はキッドの謎を解いたと確信し、ジュリが「ジョセフィン」で演じている新設宇宙劇場に直接赴き、演技中にキッドを捕らえようとした。
翌日、ジュリはコナンと仲間たちを自宅の別荘に招き、キッド計画の敗北と劇の成功を祝った。しかし、その勝利は途中のフライトで起きた殺人事件により粉砕された。偶発的だったものの、この出来事は悲劇へと発展する一連の事件を引き起こした。コナンとキッド――予想外のパートナーは――乗客全員を守るために協力しなければならない。
