В свежий день в регионе Канто Сатоши приглашает профессор Юкинари Оукидо принять участие в открытии лаборатории профессора Сакураги в Вермилленд-Сити. Пока профессор Сакураги произносит приветственную речь, он получает уведомление о возможном редком покемоне в порту Вермилленд-Сити, что заставляет Сатоши и других тренеров побежать к набережной в поисках загадочного существа. На причалах они встречают Лугия — легендарного покемона, который ведёт бой с другими тренерами.
Наблюдая за стратегиями противников, Сатоши приказывает Пикачу выпустить громовой удар по Лугии. Не испуганный, Лугия отступает, но до того как исчезнет Сатоши смело садится на его спину. К своему удивлению, к нему также прыгает другой мальчик по имени Го на спину Лугии. Вместе они мчатся, пока легендарный покемон несёт их в необычное путешествие по морю. Когда Лугия наконец возвращает их на сушу, Сатоши и Го прощаются с существом и возвращаются в Институт Сакураги.
Восхищённый открытиями Го и проницательностью Сатоши после встречи, профессор Сакураги приглашает пару стать его новыми исследовательскими партнёрами. Так начинается их экспедиция, путешествие через многочисленные регионы в поисках новых покемонов — включая тех, которые способны к Гигантмаксу.
