Весь мир ежедневно полагается на приложения для смартфонов. Однако в них обитают загадочные существа, известные как "Appli Monsters" или просто "Appmon". Эти Appmon — ИИ‑сущности, способные мыслить и действовать, живущие в переходном пространстве между человечеством и киберпространством. Среди бескрайнего океана веба конечный противник ИИ, Левиафан, заражает Appmon вирусом, захватывая их и проникая во все системы — тем самым начинает доминировать над человеческим миром из киберпространства, в цифровой сфере. Хару Шинкай вынужден получить Appli Drive, который он использует для призыва Gatchmon, монстра поискового приложения. Эта битва угрожает размыть грань между реальностью и кодом.