アクションデュエルは、デュエリストがデュエルモンスターとともに滑走・揺れ動くことを可能にし、世界中で急速に広がっています。進化の突破により、「ソリッドビジョン」システムはデュエルモンスターに質量を与えることができるようになりました。サカキ ユウヤは、マイアミシティにユウショ・サカキが設立した「You Show Duel School」の創設者である父・ユウショの息子です。ユウショは、デュエルは戦争の兵器ではなく喜びを広める手段であると主張し、エンターテインメントデュエルを導入しました。しかし、彼の名声が絶頂に達した時点でユウショは姿を消し、アクションデュエルのチャンピオンであるストロング・イシジマとのデュエルを逃しました。この突如としての失踪に傷ついたユウヤは、父と同じくエンターテインメントデュエリストになることを誓いました。数年後、ストロング・イシジマとの対決の中で、ユウヤの勝利への決意が異例の出来事を引き起こします。彼のペンダントが光り、カードがペンデュラムカードへと変わり、彼はペンデュラムサモンを行うことができるようになります。この技術は世界にも彼自身にも未知であり、瞬時に名声を得るきっかけとなります。結果として、レオコーポレーションのCEOであり名門「Leo Duel School」の創設者であるアカバ レイジは、ペンデュラムサモンをシステムに組み込むための新しいペンデュラムカードの製造を開始します。こうして、ペンデュラムサモンとユウヤの父に関する謎が解明され、ユウヤは徐々にエンターテインメントデュエリストになるための道を学んでいきます。
