カラクラの静かな町で、黒崎一護は高校生として普通の生活を送っていた――それが、人間の魂を狩る腐敗した霊「ホロウ」が家族を襲ったとき、変わる。混乱の中で彼は、親族を守ろうとした際に負傷した死神・朽木ルキアに出会う。彼らを守るため、一護はルキアの提案を受け入れ、彼女の力を継承し、結果として自らも死神となる。
ルキアが力を回復できないため、一護は町に蔓延るホロウを排除する任務を負う。彼は一人で戦うわけではない。後に、同級生の井上おりひめ・佐藤やすとら・石田うるーがそれぞれ独自の才能を持って彼に加わる。新たな責務に慣れ、前線と日常生活の両方で互いを支え合う中、一護はホロウが人類と世界間のバランスを脅かす唯一の危険ではないことに気づき、全ての生きとし生けるものが存在の繊細な調和を永遠に守るために戦う必要性を悟る。
