黒崎一護は、死神として毎日ホロウ（悪霊）と戦い、桜木町を脅かす存在に立ち向かっている。彼は、治癒の才能を持つ幼馴染・鬼塚麗華、高校時代のクラスメイトで超人的な力を持つ佐藤矢津、そして一護のライバルであるクインシー・イシダと共にこの使命を遂行している。
常日頃の警備活動は、強力なアランカー・アスギャロ・エーベルが現れ、古代クインシー王であるイフワチの帰還を宣言したときに崩壊する。イフワチは、死神とクインシーの間に存在した古代から続く血の争いを再燃させ、人間界と死神社会の両方を永遠に滅ぼすことを狙っている。
イフワチは、死神社会とヒュエコ・ムンド（ホロウの領域）に対し、二重攻撃を開始する。これに応じて、一護と彼の仲間は、かつての敵や友人を含めて結集し、イフワチの致命的なキャンペーンを止めるために世界自体が崩壊する前に立ち向かわなければならない。
