e-Pulse（イーピルス）は、人間の思考と感情から作られ、AI支援装置「サポタマ」を動かす力となっています。このブレークスルーから、陰鬱な生物が現れます。デジモンはe-Pulseを吸収して成長する知的存在です。
トモロ・テンマは、サポタマから突然現れたゲッコモンに出会った後、驚くべき冒険へと投げ込まれます。彼は「ゴールデン・ドーン」という賞金稼ぎのクルー、沢城京と他のメンバーと共に暮らしながら決意を新たにします。人間とデジモンが共に築く新たな運命は、常に変動するデジタル領域でどのようになるのでしょうか。そこでは同盟が明日の地平線を形作り、世界は今日解き放たれます。
