2025年、機械化した存在『キコウ』が突如として現れ、人類を襲撃し、数え切れない都市を完全に破壊した。文明は崩壊し廃墟となったが、後に日本でキコウの残片が発見された。これを受けて、東京キコウ研究所――トウキゲン――が設立され、キコウの兵器を研究することになった。『毒で毒に対抗せよ』という格言を受け入れ、キコウ同士で戦うことが人類の最終戦略となった。9年後、研究により『ムッツ』と呼ばれる新兵器が誕生し、戦場投入準備がほぼ整った。ムッツは人間の発想とロボット技術が融合した強力な兵器で、キコウの圧倒的な力に対抗するよう設計された。創造者は、この機体を操るのは二人のパイロットだけだと信じていた。少年リン・サガミと少女ユズル・ミドウの二人がムッツを指揮するよう選ばれ、社会の願いを戦場へと運んだ。彼らは勇敢に使命に挑むが、厳しい運命が待ち受けている。
