普通の高校生、ハオシュアン・サンは、あるとされる強盗中に捕らえられ、都市の影で蜂をモチーフとしたバイオニック模様が施された翼付き鎧を身にまとった少女によって救出されました。少女の存在はハオシュアンの穏やかな日常を乱し、彼女こそが設計された兵器ヴァンガード・リウリであることを示します。ハオシュアンは自分が「エデンの子」として全大国に追われていることを悟り、差し迫った脅威を恐れながら、真実を求めて運命に逆らいます。同時に、ハオシュアンの親しい人々――彼が憧れる先輩イェ・バイ、親友、その他の人物――も秘密の別人格を持っていることが明らかになり、彼らの隠された過去は裏切りの網で主要プロットと絡み合います。新作BEEアニメは原作漫画のストーリーラインに沿っています。さらに、作者バイマオが制作チームに個人的に参加しています。新BEEは視聴者のために完全に新しい二つのサブプロットも備えています。
