迷宮は、人々が日々集団として暮らす巨大な地下空間です。時間とともに、地表は遠い記憶へと薄れ、今日その驚異を目撃したことのない者にとっては単なる夢のようなものとなっています。地下の過酷な環境で人類が生存できるよう、コロニー住民は日々重要な専門的役割を担います。これらには、コロニーにエネルギーを供給する貴重な鉱石を採掘するワーカーズと、迷宮の予想外に緑豊かな領域へ進出し、彼らの航行を簡素化するデータを戻すマーカーズが含まれます。しかし、人類は生存そのものに対する危険に直面しています。子どもサイズから巨大構造までさまざまな「怪獣（kaijuu）」と呼ばれる獣が、地下の地形で今日どこにでも人間を敵視し危険です。さらに大きな怪獣はコロニーの壁を突破でき、人類と環境全体に対する危険性を高めます。9歳の大学卒業生メメンプは、近隣コロニーでワーカーズを大いに助ける装置を作り出しました。最近、彼女は石で縛られない無限の地平線上に終わりなき屋根を持つ領域を想像しています。こうした希望が彼女の野望を駆り立て、マーカーズに加わって迷宮の巨大な謎を解明しようとさせます。父親ガグンバーは激しく反対しますが、怪獣との遭遇が危険でありながらスリリングな探求を呼び起こし、やがて人類の運命を永遠に変えるでしょう。
