В 2027 году, год после завершения четвертой неатомной войны, разворачивается сюжет аниме. Город Новый Порт находится в процессе восстановления, когда самоподвижная мина взрывается, вызывая катастрофическое бомбежку и оставляя улицы в руинах. Вскоре после этой катастрофы военнослужащий, обвиненный в тайных коррупционных сделках с оружием, был застрелен, что вызвало напряженное расследование.
Во время расследования агент Секции общественной безопасности Дайсуке Арамаки встречает Мотоко Кусанаги, хакера, служащего в 501‑м секретном подразделении армии. Батоу — известный своим "всегда‑наблюдающим" глазом, который никогда не спит — убеждает себя, что Кусанаги устроила взрыв. Тем временем детектив полиции префектуры Ниияма Тогуса одновременно занимается двумя делами: убийством офицера и убийством проститутки. Кусанаги сама остаётся под пристальным наблюдением командующего подразделением Курутсу и других киборг‑агентов.
Production I.G Япония