Год 2045. После глобального одновременного дефолта, экономического коллапса, который потряс каждую страну Земли до основания, и быстрого роста искусственного интеллекта человечество оказалось втянутым в Устойчивую войну — конфликт, рассчитанный на вечное существование. В этой ближайшей будущей эпохе спад еще не достиг уровня, при котором обычные люди ощущают экзистенциальную угрозу, которую представляет ИИ. Постчеловеки — люди, которые интегрировали продвинутые кибернетические импланты — представляют угрозу для общества. Для борьбы с киберпреступностью, совершенной постчеловеками — новоиспеченным классом людей, — отдел общественной безопасности №9, командированный протезированным киборгом Кусанаги Мотоко, отправляется в Токио, город, оставшийся в руинах после прежней войны. Там они сталкиваются с фракцией беженцев, назвавшей себя "N", и враждебным отделением американских спецназа. Миссия отдела 9 — нейтрализовать киберугрозы и восстановить порядок в мегаполисе. По мере того как угроза ядерной войны, вызванная захваченным подводным аппаратом, усиливается, тройной конфликт между отделом общественной безопасности №9, Америкой и постчеловеками усиливается.