На планете Абел люди и андроиды живут бок о бок. Однажды теневой попутчик на грузовом судне пытается проникнуть на планету, но его ловит Аполлон (Хаято Ичиха), гуманоидный робот; и Микару (Ая Уэто), человек, похожий на механизм. Враг несёт чип данных, наполненный самым новым скрытым программным обеспечением, загадочной операционной системой "Cipher". Аполлон хватает чип ради развлечения, не подозревая о опасности, которую он несет. Вскоре его поведение становится странным, в то время как Микару остаётся неосведомлённой о причине. Что именно такое Cipher? Какие тайны он скрывает? Вместе Аполлон и Микару соберут головоломку, охватывающую историю, настоящее и будущее, чтобы раскрыть его истину. Расследование выявит хранителей, глубоко защищающих наследие города.