今後数年で、人々の10人に1人がヒューマノイドになる。ヒューマノイドは、人間の特性を鏡映するAIを備えた高度な機械で、横向きの瞳孔が特徴的だ。こうしたユニークな患者は専門医を必要とする。昼間、日向疏藤（ヒカル・スドウ）医師はヒューマノイド専用のクリニックを管理し、夜になるとモガディートとして違法手術を行い、失踪した母親の痕跡を追う。
ヒカルはこの世界ならではの様々な症例に出会う。自分とバックアップソースが同一かどうか疑問を抱くヒューマノイド、運動能力を向上できないティーンエイジャーのヒューマノイド、そして複数のオーナーの記憶を抱えるロボットぬいぐるみベア。技術が進歩し続けるにつれ、人間性を定義するより複雑な問いが浮上してくる。各ブレークスルーは人間とヒューマノイドの境界を曖昧にし、何が真に両者を区別するのかを特定することを難しくしている。したがって、クリニックは日々アイデンティティと倫理が衝突する戦場となっている。
