アクシオム教会のポンティフェックス・クインエラが討伐された後も、混乱は続いた。教会の影響力は依然として漂い、信者たちは不安を抱えている。カズト「キリト」桐ヶ谷が現実世界と再接続したとき、彼はラースのオーシャンタートル――彼が指揮する巨大な浮遊要塞―が攻撃されたことに衝撃を受けた。襲撃により突然のショートサーキットが発生し、キリトのフラックライトを損傷させて昏睡状態に陥らせた。アクシオム教会の安全を心配したアリスは、意識不明のキリトを故郷ルリッド村へ運び戻し、未解決の過ちによる追放を無視して名誉を危険にさらしながら彼を家へ連れ帰った。彼女は今、近くで静かな普通の生活を送りながら、キリトが目覚めることを願っている。 しかし、アリスが観察する限り、ダークテリトリーはすでに人間帝国を突破しているため、災害が迫っている。侵入軍は重要拠点を圧倒している。以前の身分を取り戻し、アリス・シンセシス・サーティはダークテリトリーを討伐し、彼らが守った土地に平和を取り戻すことを誓う。
