望月 駿也は、別の領域で新しい存在に順応している。信頼できるスマートフォンを装備した彼は、自由に小さなミッションを引き受けながら、新しい婚約者であるユミナ・ウルネア・ベルファスト、ヤエ・ココンオ、そして双子のリンセとエルゼ・シレスカとの時間を楽しんでいる。穏やかな環境の中でも、駿也はまだこれらの約束に伴う責務を理解し始めたばかりだ。恋愛問題と並行して、上級妖精リーンは、教授レジーナ・バビロンが五千年前に作り出した空中島「バビロン」の残りの断片を探している。駿也は不本意ながら彼女の懇願に応じ、島へ導くテレポーテーションサークルを探す旅に出る。だが、世界を滅ぼすほど強力な奇妙な獣たちが現れ、駿也は古代の技術を駆使してこれらの生物と戦わなければならない――それは彼に与えられた第二の人生を守るためだ。全ての関係を抱えながら、彼は戦い続ける必要がある。
