Три года спустя после возвращения легендарного космического корабля Ямато Земля начала восстанавливать и установила мир с Гамиланами. Однако это возрождение зависит от использования запрещённой технологии Волнового Движения.
В то же время печально известный бывший экипаж Ямато, теперь разбросанный по разным уголкам, получает психический зов от загадочной богини Терезы. Она заставляет их собраться вновь на своём дорогом судне и отправиться к далекой планете Терезарт. Им предлагается революционная сила, чтобы противостоять беспрецедентной угрозе непоколебимого Империи Гатлантис, которая продвигается к Земле с враждебными намерениями.
Привлечённые её призывом экипаж собирается вновь и отправляется в очередную опасную межзвёздную экспедицию через неизведанные космические потоки, где древние реликвии находятся в покое, а хрупкая надежда галактики зависит от них для рассвета, чтобы защитить будущее всех разумных миров и обеспечить мир.
