Действие происходит за столетия после оригинальной саги: Yamato 2520 повествует о приключениях восемнадцатого судна, несущего имя, и его борьбе с Федерацией Сейрен.
На планете, жестко управляемой Доминионом Серен, группа юношей Земли обнаруживает давно забытый обломок линкора Федерации Земли Yamato. Захватив его ядро данных, молодые люди используют автоматизированные верфи Серен для восстановления нового Yamato будущим поколениям и почтить своё наследие.
