Гамиланы сталкиваются с величайшим испытанием: их мир быстро ухудшается. Чтобы спасти свой народ и перевезти его в пригодную для жизни территорию, Абердт Деслер притворяется подчинённым тираническому режиму Гальманов, планеты, населённой видом почти идентичным гамиланам. Реальный план Деслера — взять командование и ускорить спасение своей нации. Однако, когда гамиланы начинают свой исход, неизвестная колоссальная сила наносит удар и полностью искажает их двойной мир — Исцандар, резиденцию королевы Старша.
В то же время Земля радуется триумфу великолепного космического корабля Ямато и его отважной команды. Новая группа талантливых рекрутов садится на Ямато вместе с двумя новыми вспомогательными кораблями, командуемыми Юки Мори и Широ Санадой. Тем не менее, не все поддерживают прежние решения капитана Сусуму Кодай. В течение шестимесячного тренировочного плавания Ямато и дипломатического взаимодействия с гамиланами экипаж обнаруживает недавнее бедствие, и вопреки всем директивам Кодай приказывает флоту отправиться в Исцандар, чтобы помочь оставшимся беженцам.
