Кризис надвигается над Землей, когда блуждающая чёрная дыра расширяется в 2220 году. Планируется переселить более 300 миллионов жителей с Земли. Когда новый транспортный конвой поражён, космический боевой корабль Ямато вмешивается; теперь он возглавляет Сусуму Кодай, а его дочь Миюки находится на борту как дитя Сусумы и Юки.
