В полнолуние вечером Токийский национальный институт микроорганизмов становится жертвой загадочной фракции, назвавшей себя "Красные сиамские кошки". Группа взорвала укреплённый лабораторный комплекс, содержащий 80‑процентную смертельную вирусную инфекцию без средства лечения, и последовавший ужас захватил мировые заголовки, превзойдя грандиозное открытие Джирокичи Сузуки самого большого дирижабля планеты. Лаборатория, классифицированная как высший уровень безопасности, хранила патоген. Странно, но в церемонии присутствует записка, адресованная Кайто "Кайтёу Кид" Куробе, бросающая ему вызов украсть ценное экспонат — великолепную Lady Sky.
Конан Эдогава получает доступ к дирижаблю вместе с Когоро Мурой, Ран Мурой, Соноко Сузуки, профессором Агаса и Детективными мальчиками. Их веселье прерывается, когда неизвестный звонящий сообщает Джирокичи о высвобождении вируса в курильном зале. Волнение публики переходит в ужас, когда тревоги звучат; у пассажиров вспыхивают симптомы, разжигая панику. Красные сиамские кошки используют хаос, высаживаются и захватывают дирижабль.
Чтобы остановить нападающих, Конан и Кайтёу Кид должны объединиться со своими спутниками, распутать улики и раскрыть истинную мотивацию Красных сиамских кошек до истечения времени.