花を愛する若い少女、花咲つぼみは普段恥ずかしがり屋で控えめです。しかし、家族が新しい町へ引っ越すとき、彼女は新しい学校で自分を大胆で表現力豊かな人に変える決意をします。引っ越しの日、彼女は空中に浮かぶ奇妙な木を想像します。その木は「キュア・ムーンライト」という戦士に守られています。つぼみはすぐにこのビジョンが現実であることを知ります。彼女が出会った二人の謎めいた妖精、シプルとコフレが奇妙な女性に追われているのです。その女性は巨大な獣を呼び出し、街を包囲します。つぼみはそれを撃退するために戦士へと変身せざるを得ません。彼女は「キュア・ブロッサム」の称号を受け、女性が世界を乾かそうとする悪質なシンジケートに属していることを知ります。新たな使命はその計画を阻止することです。つぼみがさらに多くのモンスターに立ち向かい、キュア・ムーンライトの謎を解き明かす中で、彼女は自分の内気さを超えるために必要な自信を得られるでしょうか？
