新堂有田検事とミハイル・ケイ・イグナトフの二人は、危険な陰謀を暴露した。
シビル・システム、日本の最高人格裁定機関は、影で静かに財産と権力を蓄積する秘密結社によって裏切られている。
今、ビフロストの作戦員安澤光一は、犯罪捜査部を直接攻撃し、本部を占拠して新堂検事と全職員を人質に取る。
CIDユニット01の指揮官は、シモツキミカ長と元仲間の小上真也・木野座信一とともに、混乱の中で施設を奪還し、すべての人質を救出しなければならない。
人質危機と安澤の東京知事小宮香梨への辞任要請の中で、裏で暗い計画が進行している――新堂検事に安澤だけでなく、彼の深く埋もれた過去の記憶にも直面させる秘密の陰謀。
これらの展開は、彼と親友イグナトフを何年も悩ませてきた謎を明らかにするため、徐々に彼を近づけている。