В Универсальной Эпохе 0096, три года спустя после неудачной попытки Шар Ацнобла заставить человечество выйти в космос, жизнь продолжается на орбитальных колониях вокруг Земли. Одно из таких поселений, Side 4, принимает Банагера Линкса, шестнадцатилетнего подростка, который держится в стороне от одноклассников.
Аудри Берн, единственная наследница когда‑то страшной династии, решает захватить ключ к легендарному устройству под названием "Коробка Лапласа". По преданиям, Коробка может управлять самой тканью реальности, поэтому она отправляется в Side 4, чтобы вырвать его у нынешнего владельца и предотвратить захват со стороны Sleeves — выживших из Новой Зеона Шара Ацнобла. Её мотив — удержать эту силу от смертных рук. В ходе своего поиска она встречает Банагера, навсегда изменяя его судьбу.
Когда Side 4 подвергается нападению Sleeves и их известных бойцов Мариды Круз и Фулл Франтала, Банагер командует новоиспеченным Гундам Уникорном, чтобы защитить своих друзей и обеспечить будущее человечества. Битва проверяет его решимость, заставляя столкнуться с наследием собственной родословной.
Sunrise Япония