林太郎の故郷は巨大な機械によって破壊され、彼の両親は虐殺の最中に亡くなった。
彼は失われたものの重みが決意を押しつぶすように感じている。
彼の唯一の仲間は犬のジャックで、残されたものは母親の靴と、彼が死に際で父親から聞いた、本当の両親だった男性と女性の写真だけだ。
都市の廃墟は、永遠に失われた人生の記憶を響かせている。
今、林太郎はロボットの送信者とされる恐ろしいゴーストシップに対して復讐を求めている。ゴーストシップは船舶を危険にさらし、全滅を望むと囁かれている。
しかし、林太郎は都市の主要な大富豪である黒糸氏が運営する地下に隠れた工場を発見し、彼の話は欺瞞であると悟る。
海上要塞の下に恐ろしい存在が住んでいる。
林太郎は真実を明らかにしようとするが、匿名の脅威によって命を危険にさらされる。
最終的に、林太郎はゴーストシップの乗組員である指揮官に救出される。
ゴーストシップの伝説は世界中の船員に恐怖を広げている。
林太郎は単一の秘密だけでなく、さらに多くを発見する瀬戸際に立っている。
