麦わらの一味は新世界の荒れ狂う海へと航海し、伝説の海賊王ゴール・D・ロジャー――ワンピースの elusive treasure を追い求める。旅の途中で、恐ろしいほど強大な存在、元海軍提督Zに遭遇する。噂によれば、Z は「ダイナストーン」を奪取したとされる。これらの遺物は新世界を不安定にする力を秘めていると言われており、海軍本部は彼がそれらを使って海賊行為を終わらせようとするのではないかと恐れ、無数の無実の命を危険にさらす可能性があると懸念している。これに対し、海軍は元提督に対抗するため動員を開始した。海軍や艦隊との衝突の可能性があるにもかかわらず、麦わらの一味はZを追い、彼が混乱をもたらすことを防ぐ決意を固める。進むにつれて、海賊たちは新しい仲間と馴染みのある顔に出会う。彼らの冒険は、絆と決意を試し続ける一方で、海は今日もますます予測不可能になっている。