К сожалению для Мейко Мочизуки, её дигимон-компаньон Meicoomon вынужден превратиться в Meicrackmon, поддаваясь зловещему влиянию во время трансформации. Когда Meicrackmon исчезает, чтобы разжечь хаос в другом месте, кажется, что Само Цифровой Мир начинает отвергать Мейко и других Избранных Детей. Пока они уклоняются от многочисленных врагов, преследующих их, группа стремится найти путь домой. Их путешествие полно опасностей: невидимые угрозы подстерегают на каждом повороте.
В человеческом мире посланник из загадочной силы Homeostasis подходит к отцу Мейко и Дайго Нисидзиме из Инкорпорированной Административной Агентства, чтобы поговорить о происхождении Meicoomon. Посланник сообщает им, что Homeostasis намерен уничтожить цифровое существо, стремясь остановить появление новых Дигимонов в человеческом мире — независимо от того, как к этому относятся Избранные дети.