Вход в Цифровой Мир был закрыт три года. Таити Ягами и его спутники прошли дальше, а теперь, став второкурсником, пришло время ему вырасти. Пока все остальные определились со своими будущими путями, Таити остаётся нерешительным. Раньше они делили мечту о приключениях, но теперь каждый выбрал свой собственный маршрут, и друзья разобщаются, преследуя разные направления.
Однажды появляется бунтующий Дигимон в форме насекомого по имени Кувагамон и вызывает хаос в электронике города. Таити импульсивно преследует его, но оказывается пойманным существом. Внезапно его Дигивайс — универсальное устройство, которое может призывать союзников, раскрывать скрытый потенциал и помогать эволюции партнёра Дигимона — загорается, и Агумон материализуется. Вместе они побеждают Кувагамона, но почему Дигимон пересёк в этот мир? Что происходит в Цифровом Мире, и как это связано с Мейко Мочизуки, новой ученицей-переводчицей в классе Таити? Тайна углубляется, когда появляются новые подсказки.