大輔小畑は、フィジー諸島にある小さな島パゴパゴに住んでおり、海洋学者の父・鉄男と共に暮らしています。島が嵐に見舞われた際、大輔はジェットスキーでラグーンへ向かい、奇妙な幼い恐竜を発見します。彼はそれを父の研究室に持ち帰り、名前を「クー」と名付けました。
クーは成長し、大きな海棲爬虫類に似た姿を取り、約6500万年前にこの場所を泳いでいた幼年プレスオサウルスのようです。しかし、クーはすぐにフランス情報機関の注意を引きます。この機関は、平穏なこの地域におけるフランスの核資産を保護し、太平洋での沿岸防衛と国際外交の戦略的監視を担っています。