После завоевания галактики человечество достигло своего апогея и теперь переживает постепенный упадок. Запасы космоса иссякают, что приводит примерно к 500 миллиардам людей, возвращающихся на Землю. Это вызывает конфликт между человеческими фракциями, соревнующимися за планетарное господство, и борьба обостряется до войны. В конечном итоге автократический режим под названием Гайя Санкшн прекращает репопуляцию Земли и вводит строгий контроль.
Капитан Херлок, выдающийся член Элитного Вингa, был назначен Гайей Санкшн защитить Землю. Под его командованием флот оказался непобедим и внушал страх по всей галактике. Однако режим разрешил дипломатической элите поселиться на Земле, что разозлило Херлока. В ответ он стал мятежником, атакуя дипломатов и даже собственные корабли. Затем он выпустил темную материю на планету, чтобы сделать её непригодной для жизни, но в процессе был поглощён ею и приобрёл бессмертный статус.
Прошло сто лет, но легендарный капитан Херлок всё ещё свободен и командует только Аркада. Гайя Санкшн продолжает попытки доминировать над Землей, скрывая истинное состояние дел. Тем не менее Херлок готовится к решающему столкновению с ними, финальному бою, который определит судьбу планеты и решит, сможет ли человечество выжить.
Toei Animation Япония