В 2148 году, два года после завершения оригинальной саги "Фафнер" на телеканале Azure, остров Татсумия и его оставшиеся жители начали восстанавливать. Однако ситуация становится всё более критической для нашего главного героя, Казуки — теперь почти слепой и частично инвалид из‑за предыдущих столкновений с Фестумом. Он держится за клятву, которую дал его погибший товарищ Соши: вернуться и восстановить порядок. Надежда вспыхивает, когда в одном ночном путешествии безмanned субмерсивного аппарата, дрейфующего в залив Татсумия, обнаруживается живое существо. Однако пассажиром оказывается не Соши, а странный юноша по имени Мисао Курусу, который утверждает, что был послан Соши. При появлении Мисао возобновляется конфликт между Человеческой армией и Фестумом, заставляя пилотов Фафнера вступить в самую опасную битву — теперь судьбы обеих рас находятся на кону.
Xebec Япония