Во время премьеры фильма Гинтоки арестует, как предполагается, кражу кино. После просмотра видеозаписей охраны его уносят в пустынную, послевоенную версию Эдо, где загадочный вспышка, названная "Белой чумой", уничтожила человечество. Стало ясно, что обвиняемый в краже на самом деле был андроидом-устройством времени, и Гинтоки был перемещён на пять лет вперёд! Шинпачи и Кагура, его бывшие союзники из Йорозуя, разошлись и теперь действуют как суровые одиночные воины, а Гинтоки исчез на годы, оставив лишь загадочное сообщение в своём дневнике.
Оборудованный маскировкой, предоставленной машиной времени, Гинтоки неуклюже собирает группу Йорозуя, чтобы исследовать Белую чуму. Он вскоре узнаёт, что спасение завтрашнего дня зависит от того, как он столкнётся с тенями своего собственного прошлого. С решимостью встретиться с могущественным противником, он обнаруживает, что при наличии разорванной команды спутников и сторонников рядом с ним ему не нужно бороться в одиночку. Их совместный опыт и связь дают им надежду против надвигающейся угрозы, доказывая, что единство может преодолеть даже самую тёмную отчаяние.