大戦の後、人々は故郷の惑星を離れ、別の完璧な「天上世界」へ移住した。すぐにそれは崩壊し、予言者たちは人類が故郷へ戻り、再び1万年の歴史を経験しなければならないと悟った。そうすべき初めて、赦しを得て星々への道を取り戻せるのだ。地球では「帰還者」が住める場所を一つだけ見つけた――もちろん日本だ！―残された少数の先住民が暮らす。密集したくないと考えた「進化者」は平行次元を作り、世界史の再創造という壮大なプロジェクトを始めた。残念ながら、新時代の17世紀レベルで誰かがミスを犯し、ポケットワールドは崩壊し、その住人たちは古き良き地球に転送された。もう礼儀正しくはなく、「新地球人」は魔法のような科学を持つ現地住民を追い出した。彼らの力は来訪者の圧倒的な力に勝てなかった。今、追放された人々は巨大な空飛ぶ船で暮らし、「生命の支配者」と対決し、故郷を取り戻すために力を蓄えている。唯一の道は全面戦争ではなく、再び始まった歴史的リコンストラクションに参加することである――闘う地球の時代からだ。こうして「ムサシ」号に、遠い未来の日本の若き戦士たちが集結する――生まれ変わったガンダムから恐ろしい団子まで。彼らのリーダー、トリ・アオイは運命に選ばれた遺伝的将軍で、歴史の流れを変える行動を取る準備ができている。以後、勝者こそが正しい！
