人類は、強大なスパイラルキングが討伐された日――地球を再び故郷として取り戻した瞬間から、七年間にわたり豪華で静寂かつ繁栄する暮らしを楽しんできた。しかし、この特権は、見えない敵が増大する人間社会の中に現れたとき、彼らを不十分な準備へと追い込む。あの災厄はアンチ・スパイラルであり、比類なき恐怖の対立者だ。
スパイラルキングが予言した「スパイラルの世界」が破壊されるという予測が現実化し始め、すべての要素が揃い、チーム・ダイグレンは立ち上がる。亡き兄の人類に明るい未来をもたらす夢に駆り立てられ、サイモンはニア・テッピルンと残りの隊員たちとともに、強大なアンチ・スパイラルを倒し、人類の失われた希望を取り戻す決意を固める。今日、そして未来の世代に迫る絶望の中で。