寒い12月の朝、キョンはSOSブリゲード仲間と共にもう一度遠足へ出かける準備をして学校に入った。しかし、ほとんどすべてが変わっていることに驚く。鈴木ハルヒと小泉一樹は不在で、朝比奈ミクルは彼を認めず、長門有希は普通の人間のように振る舞い、そして浅倉涼子が不可解に再登場する。超常的な事柄に慣れたキョンだが、この奇妙な変化に不安を覚え、独りで謎を解明する決意を固める。彼の感覚は廊下が違うように感じられ、まるで時間そのものが再編成されたかのようだ。以前の現実を唯一目撃したキョンは、重要な選択に直面する。彼がずっと渇望してきた普通の生活を受け入れるか、時間を巻き戻し混沌とした慣れ親しんだ世界を取り戻す方法を探るか。混沌を復活させたい衝動が彼の決意を逆転へと引き寄せる。