キョンは最近、SOSブリゲードとそのエネルギッシュなキャプテン・涼宮ハルヒのおかげで、数えきれないほどの冒険に巻き込まれるようになった。彼は長い間超自然への信仰を捨てていたが、そのクラブに参加するよう強制されたことで、合理的な説明を超える出来事を目撃せざるを得なくなった。
キョンと共に冒険するのは、控えめで優しい朝日奈ミクラ、学究的な長門有希、そしていつも陽気な小泉一樹だ。夏休みや学園祭のどんな活動でも、彼らのクラブとハルヒに関わるものは必ず奇妙な方向へ転がり込む。彼らの集団的ないたずらは、みんなを警戒させ、宇宙を揺るがす。
