宇宙人の勢力が、平和の象徴としてマジンガーZの隣にある博物館入口に立つグレート・マジンガーを奪取する。グレンディザーは侵略者と戦い、最終的にグレート・マジンガーを正当な場所へ戻す。ヴィーガン帝国は地球占領を監督する新将軍を派遣し、彼はコウジ・カブトを迅速に捕らえ、グレート・マジンガーについての情報を尋問し、博物館展示からロボットを乗っ取る。現在、グレンディザーに乗り込むデューク・フリードは、人類のかつての守護者がかつて保護した破壊者になる前に止めなければならない。彼はそれが地球を破壊する前に行動しなければならない。
