2050年、日本は気候変動によって引き起こされた海面上昇により水没している。東京もその被害を受けている。
国の経済は崩壊し、当局は繁栄を取り戻すための対策を採用した。その結果、JESAS(ジェサス)という軍事組織が設立され、その陰険な目的は日本の未来を支配することである。JESAS は核廃棄物を宇宙へ処分する業務も監督している。
脅威から身を守るため、JESAS は A.I.(正確な直感)に導かれるパイロットが操縦する R.B. ロボット兵器を開発した。これに対抗しているのが、地球を守るために結成された国々の連合「グリーン・フロンティア」である。
物語は、JESAS のパイロットであるカンナとカズトと、グリーン・フロンティアのメンバーであるドオタ・カンとミラ・ユを中心に展開する。4人の若者は、愛と友情、義務を通じて地球の運命を形作る。
彼らは二つの勢力が衝突し、どちらも自分たちの道が正しいと信じている様子を目撃する。彼らの選択は大陸に波紋を広げ、未来の世代へ影響を与える。JESAS の活動は、支配力を独占しようとするより暗い動機を隠している。グリーン・フロンティアのネットワークは草の根支援に依存し、世界的な生態学的バランスを目指している。