再生されたヒミコは、かつてヤマタイの主権者であったが、関東にいるすべての円璽（まがたま）を持つ者に対して戦争を開始することを決意した。彼女の消えた領土を取り戻すためには、本物の三種の聖宝（日本の三神器）を集めなければならない。
ヒミコの仲間である山田朝明が、彼女が欲しがる聖剣を宿す南陽学院を容赦なく襲撃すると、白風薩楽の新たに発見された妹である中部聖剣がドラゴンを召喚するも倒れ込む。仲間を救うために駆り立てられた白風は、命を奪われる可能性のある訓練を受けるという伝説の場所、浄福寺で自らの円璽を取り戻さなければならない。
浄福寺で生者と死者の間の幕が薄くなる中、関東の戦士たちは集結し、迫り来る黄昏と上がる月光の中でヒミコの謎めいた計画を阻止しなければならない。
