まどか・かなめとさやか・みきは、中学生として普通の生活を送っているが、彼女たちのすべては、猫型の魔法使いの同伴者であるキュゥべーと、最近転校してきた生徒・暁美ほむらに出会った瞬間から変わる。
キュゥべーは彼女たちに取引を提示する。彼は彼女たちの願いのうち一つを叶える代わりに、各自が魔法少女へと変身し、願いを実現するために必要な力を得るというものだ。
しかし、すでに魔法少女である暁美ほむらは、彼女たちに契約を受け入れることを警告し、現実は見た目以上に欺瞞的だと主張する。
『魔法少女まどか★マギカ』は、希望・悲しみ・仲間意識の物語を紡ぎ、魔法少女であることの試練と、夢を現実に変えるために背負わなければならない重い見えざる代償を探求する。
