ロングのバクガン・ナガの究極的な敗北を受け、ヴェストリアは戦争後に永遠の平和へと復帰した。ダンマ・クウソー、彼の仲間ピリウス・ドラゴノイド、および他のバトルブラウラーたちとともに、インフィニティ・コアとサイレント・コアを融合させて領域を再建した。しかし、新ヴェストリアは休むことなく、ヒューマノイドの宇宙人侵略者「ヴェスタル」が即座に到着し、バクガンの世界を一掃で掌握した。恐ろしい力強い装置を備え、バクガンをボール形態にロックすることで、人種を娯楽のために奴隷化しようとする。今、彼らに対抗する唯一の抵抗はバクガン・バトルブラウラーズ・レジスタンスであり、人間、バクガン、ヴェスタルの連合体が知的種族の絶滅を拒む。ダンマに導かれ、彼らは占領された新ヴェストリアへ潜入し、侵略者を粘り強く押し返して世界の存続を確保する必要がある。
