バクガン・インタースペースは、競技者が対戦し、組織化されたトーナメントに参加できる最先端の仮想現実プラットフォームです。もともとはバクガン技術を磨くために考案されましたが、すぐに熱心なファンの中心的集会場所となりました。ダンマ・クウソウの激しい対決の一つで、インタースペースシステムが突然崩壊し、彼は気を失います。意識不明のまま、混沌とした戦場で再びバクガンが衝突する鮮明な幻覚を体験します。ダンマの戦いで放出されたエネルギーの急上昇がシステムを停止させ、全銀河に波紋を広げ、強力なガンダリアン組織「十二オーダー」の深い関心を引きました。彼らはネアシアンに対する戦争のためにトップレベルの戦士を採用する目的で、バクガン・インタースペースに潜入します。ダンマは仲間のカザミ・シュンとマルクラ・チョウジとともに、すぐにこの星間紛争へ巻き込まれます。戦争は遠く感じられるかもしれませんが、地球の主権を脅かし、バクガン種族の未来を危うくします。
