運命に満ちた午後、三崎陽太郎は荒しむとうという見知らぬ人に波から引き上げられる。岸に着くと、荒しむとうは陽太郎を起こし、彼の名前を尋ねる。記憶が急速に蘇るものの、身元を明かす代わりに陽太郎は過去について無知であるふりを選ぶ。
海は彼の体と同じくらい確実に記憶を飲み込み、生存という衝撃は彼に空虚な自己感覚を残した。荒しむとうは少年の脆弱な状態に気づき、世話をしてくれ、彼の飲食店「クラゲの食堂」で一時的な宿泊を提供する。そんな親切さにもかかわらず、陽太郎は海に漂い込んだ経緯を覚えていないと主張し続ける。家族や故郷を捨てた後、この作り上げられた健忘症者はどのように人生を歩むのでしょうか。