UAアカデミーのクラス1-Aは、昨学年度にわたる一連の悪党襲撃を耐え抜いたことで、相当な世間の注目を集めました。この注目はライバルクラス1-Bに不満と自らの実力を示したいという熱意を抱かせました。彼らは今、二つのクラスが対決する模擬デュエルシリーズでその機会を待ち望んでいます。
両クラスはそれぞれ四人ずつのチームに分かれ、相手側からメンバーを捕獲することが課題です。全ての対戦相手を先に捕らえたチームが勝利とみなされます。表面的には単純に見えるこの競技ですが、ヒーローコースへの進学を目指す総合科の学生・新庄仁史が登場することで複雑さを増します。彼はクラス1-Aの担任である相沢翔太(通称「エラスヘッド」)のもとで訓練し、ヒーローとしての潜在力を示そうとしますが、未熟さゆえに他者より遅れを取っています。それでも新庄はこの障壁を乗り越える決意を固めています。
こうしてクラス1-Aと1-Bの間に激しいライバル関係が生まれ、両クラスとも自らの優位性を証明しようとしています。