В 2035 году в японской исследовательской станции вспыхивает бедствие, названное "Взрывом", которое породило агрессивно растущее, жадное, самоудваивающееся существо под названием "Материя". Оно ползает сквозь обломки дамб и оборонительных сооружений в Курубе-Горге, пока специальные силы пытаются остановить его от достижения моря, а наемники ищут ответы о его происхождении.
После того, как её спасли от Материи, Аико Тачибана находится под непрерывным медицинским наблюдением. Она проводит период восстановления, создавая оригами‑самолёты.
Её школьная рутина вскоре нарушается, когда в школу поступает переводчик Юйя Канзакі и отмечает несколько аномалий в её физиологии. Почему она избегает вреда, и почему ей больше не нужен инвалидный кресло? Он настаивает, что в ней есть больше, чем ей сказали, и только она может остановить Взрыв.
Поскольку к Аико проявляет интерес множество групп, она и Юйя должны собрать поддержку и отправиться в опасное путешествие к сердцу ущелья, прежде чем враги закрепят их судьбу. Чтобы избежать заговоров против них, они сталкиваются с Материей — врагом, движущимся как жидкость.
